علماء الأوبئة مستنفرون: فحوص الحمض النووي المخبرية تتبّع أصول "كورونا"

ترجمة: عبير علي حطيط

2020.01.27 - 02:53
Facebook Share
طباعة


بينما يتنافس أخصائيو الأمراض المعدية وعلم الأوبئة لاحتواء انتشار فيروس كورونا الجديد المتمركز في ووهان الصينية، يحصلون على نسخة احتياطية باتت متاحة منذ اختراع التقنيات الوراثية وتساهم في الغوص العميق في الحمض النووي للفيروس المعروف باسم "2019-nCoV".

وتقدم تحليلات الجينوم الفيروسي بالفعل أدلة حول أصول التفشي وحتى الطرق الممكنة لعلاج العدوى، وهي حاجة أصبحت أكثر إلحاحاً كل يوم، حيث وصل عدد الوفيات بالفيروس إلى 41. وهناك الآن ما يقرب من 1100 حالة مؤكدة.

كما تسمح تلك القراءة للباحثين بمراقبة كيف يتغير "2019nCoV " توفر خريطة طريق لتطوير التشخيص واللقاح.

وقالت عالمة البيولوجيا الجزيئية كريستيان أندرسن، وهي خبيرة في الجينوم الفيروسي أنه يمكن لعلم الوراثة إخبارنا بالتوقيت الحقيقي للحالات الأولى، وما إذا كانت قد حدثت في وقت مبكر عما أدركه المسؤولون. كما يمكن أن تخبرنا كيف تفشى المرض، وما يعزز انتشار المرض.

وقام علماء في الصين بترتيب تسلسل جينوم الفيروس وإتاحته بعد شهر واحد فقط من تقرير 8 كانون الأول/ديسمبر الذي أعلن عن أول حالة إصابة بالتهاب رئوي من فيروس غير معروف في ووهان.

وقال أندرو رامباوت من جامعة إدنبرة، وهو خبير في تطور الفيروسات أنه منذ القيام بترتيب تسلسل أول عينة "2019-nCoV"، أنهى العلماء ما يقرب من عشرين جينوم أخرى. فيما قال أندرسون ، الذي عمل على ترتيب تسلسل جينوم الإيبولا خلال تفشيه عام 2014، أن هذه الوتيرة لم يسبق لها مثيل ولا يمكن تصديقها على الإطلاق.

يبلغ طول جينوم الفيروس 29.903 قاعدة، وهي واحدة من العديد من الأدلة التي دفعت العلماء إلى الاعتقاد بأنها تشبه فيروس "سارس".

بمقارنة العشرات من الجينومات، يمكن للعلماء معالجة سؤال "متى بدأ ظهور هذا الفيروس". وتظهر العينات الـ 24 المتاحة، تباينًا وراثيًا محدودًا للغاية، واختتم رامباوت - الذي كان يتحدث خلال منتدى للمناقشة عبر الإنترنت حيث تبادل علماء الفيروسات البيانات والتحليلات - أن هذا يدل على وجود سلف مشترك حديث نسبيًا لجميع هذه الفيروسات.

بالنظر إلى ما هو معروف عن السرعة التي يتغير بها الجينوم الفيروسي، تبين أنه إذا كان"nCoV" ينتشر بين الناس منذ الإبلاغ عن الحالة الأولى، فإن الأربع وعشرين جينوم ستختلف أكثر. وعند تطبيق المعدلات التقريبية لتطور الفيروس، يقدر رامباوت أن فيروس آدم (أو حواء) الذي تنحدر منه كل الفيروسات الأخرى قد ظهر أولًا قبل 30 تشرين الأول/أكتوبر 2019.

وبحسب أندرسون فإن الفيروس السلف كان من شبه المؤكد أنه ينتشر بشكل غير ضار في الخفافيش، ولكن لديه "خزان وسيط" في حيوان واحد أو أكثر يتلامس مع الناس. ومن المفترض أن هذا الخزان هو أحد أنواع الحيوانات في ووهان الذي يُعتقد أنه سبب تفشي "2019-nCoV" الذي اكتسب طفرة جينية جعلته قادراً على الانتقال وإصابة البشر.

كما تشير تسلسلات الجينوم إلى أنها كانت قفزة لمرة واحدة فقط. حيث قال أندرسون إن هذا يعني أن ما يحافظ على الانتشار هو انتقال من إنسان إلى إنسان، مما يشير إلى أن إغلاق سوق الحيوانات في ووهان هو أمر حتمي.

ولسوء الحظ، لا يمكن للتحليل الجيني تحديد أنواع الحيوانات التي انتقل من خلالها فيروس كورونا إلى البشر. لكن تحليلاً قام به فريق من معهد ووهان للفيروسات حدد أن جينوم هذا الفيروس كان مطابقًا بنسبة 96٪ لتحليل فيروس الخفافيش الإكليلي، وذكر فريق آخر من العلماء في الصين أن فيروس كورونا الجديد مطابق بنسبة 86.9 ٪ لفيروس شبيه بسارس.

يختلف علماء الفيروسات حول ما إذا كان من الممكن قراءة الخواص الفيروسية من تسلسل الجينوم فقط. ولكن التحليل الذي أجراه فريق معهد ووهان وجد أن هذا الفيروس يدخل الخلايا البشرية باستخدام نفس المدخل الذي ظهر به سارس، وهو أنجيوتنسين الذي يحول الإنزيم 2 (ACE2)، هو مُستَقبِل يقوم "البروتين المرتفع" على سطح الفيروس أولًا بتوصيله ثم يمكّن الفيروس من الاندماج مع الخلية المُضيفة.

وإذا كان ACE2 "مخادعاً"، فقد يؤدي إلى معالجة "2019 nCoV " وكتب العلماء أنه يمكن استخدام الأدوية للمرضى المصابين بعد القيام بتحليلات مرتبطة بهذا الإنزيم.

تسلسل الجينوم يعطي معلومات أكثر، إذ قال عالم الأحياء ريتشارد إيبرايت من جامعة روتجرز إن هذه الخطوة مهمة للغاية لتطوير التشخيص واللقاحات.

يقول راؤول داندا، الرئيس التنفيذي لشركة شيرلوك، الذي رفض مناقشة "خطط محددة متعلقة بفيروس كورونا" إن رؤيتهم تتمثل في أن المنصات المستندة إلى كريسبر مصممة خصيصاً لتفشي الأمراض مثل فيروس كورونا".

وبينما يواصل العلماء إضافة تسلسل جينوم "2019 nCoV" إلى مجموعتهم، يُمَكِّنَهم من الحصول على لمحة مبكرة عما إذا كان الفيروس يتحور بطريقة تجعله أكثر خطورة أو أكثر قابلية للانتقال. يعترف أندرسون أن العلماء بحاجة إلى تسلسل مستمر.
 
Facebook Share
طباعة عودة للأعلى
اضافة تعليق
* اكتب ناتج 2 + 1